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FerLab est une équipe en développement logiciel au Centre de recherche du CHU Sainte-Justine sous la supervision du Dr Vincent Ferretti.

Notre équipe est un soutien indispensable à la progression de la recherche en génomique et biomédicale. L’objectif de Ferlab est de développer des applications et technologies efficaces qui servent à optimiser l'utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l'amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.

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Une équipe du CHU Sainte-Justine

Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications et technologies que notre équipe développe, servent à optimiser l'utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l'amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.

Analyste de données

Nous recherchons un développeur spécialiste de données médicales pour travailler au sein de l’équipe de la plateforme de mégadonnées (UniC) qui intègre l’ensemble des données clinico-administratives générées par l’hôpital. Cette plateforme est constituée d’un lac de données alimenté par les différents systèmes hospitaliers, ainsi qu’une gamme d’outils analytiques performants adaptés à la science des données massives.

Votre rôle

Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission.

En tant que membre de l’équipe Ferlab, vous rôle consistera à :

Construire des pipelines ETL Extract, Transform, Load) pour enrichir l'entrepôt de données et développer des jeux de données pour la recherche.
Harmoniser des données hétérogènes en appliquant des standards tels que le modèle OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) et/ou le standard FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) et faire le mappage de terminologies médicales vers des référentiels internationaux standardisés (ex: CIM-10, SNOMED, LOINC).
Collaborer avec les chercheurs du CHUSJ et de d'autres établissements pour préparer et analyser des jeux de données.
Utiliser des modèles d'IA générative (LLM) afin d'extraire et standardiser les données médicales à partir des notes cliniques ou autres sources de données non-structurées.
Préparer et documenter les spécifications requises pour l’élaboration des jeux de données.
Appliquer des transformations de données quantitatives, notamment la normalisation des données.
Assurer la qualité des données.

Notre stack technique

Nous privilégions l’utilisation de logiciels Open Source, publiés sur GitHub et sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire. Nous travaillons avec les langages Scala, Python et R. Nous utilisons les plus récentes technologies telles que, par exemple, Airflow, Delta lake et Iceberg, ElasticSearch, PostgreSQL, S3 (Minio).

Nous cherchons une personne ayant:

Un diplome universitaire en informatique, statistique ou domaine équivalent
Une connaissance des données hospitalières et de la nomenclature et codage des diagnostics et procédures médicales
De l’expérience dans l’application d'approches de l'intelligence artificielle dont l’optimisation des performances des modèles de langage et l'application d'instructions génératives avancées.
De l’expérience en langages Python, R, Scala ou autres.
De l'expérience avec le versionnage de code (Git).
De l’expérience avec AWS ou autre plateforme infonuagique et object stores S3
De la facilité à travailler dans un environnement agile et collaboratif
De bonnes habiletés de communication (Français et Anglais)
Proactif et débrouillard, être capable de se mettre en mode solution!

Conditions

Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse !

35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire

Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines

9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles)

13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST)

Fonds de pension généreux – l’un des meilleurs sur le marché

Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille

Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel

Possibilité de télétravail

Environnement de travail Linux ou Mac à votre choix.
La maîtrise du français, tant à l'oral qu'à l'écrit, est essentielle pour ce poste.

Joignez-vous à nous et mettez vos compétences au service de la santé des enfants. Postulez par courriel au carrieres@ferlab.bio.

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Ferlab | Développeur | Full-stack senior

Une équipe du CHU Sainte-Justine

Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications logicielles que l’équipe Ferlab du CHU Sainte-Justine développe servent à optimiser l’utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l’amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.  

Développeur | Full-stack senior

Une carrière complètement différente

Notre équipe s’agrandit ! Vous désirez mettre votre expérience en développement et en implantation d’outils au profit de la cause et ainsi contribuer positivement à la société ? C’est dans une atmosphère d’entraide et d’harmonie que nous faisons avancer les mandats qui nous tiennent à cœur.

FerLab est à la recherche d’un développeur full-stack doté d’une solide expertise en développement logiciel web. Un leader naturel qui prend les devants, entraîne les autres et qui souhaite contribuer activement à des projets innovants.

Votre rôle 

Libre dans vos fonctions

Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission.

Concevoir, corriger et tester des fonctionnalités en React

Concevoir, corriger et tester des fonctionnalités Nodejs, Spark et/ou Scala.

Améliorer la qualité du code et des applications par l’écriture de tests.

Contribuer à bâtir une librairie de composantes spécialisées et partagées entre nos applications.

Assister à différentes rencontres de projet lorsque nécessaire.

Proposer des solutions d’amélioration et d’avancement technologique pour les différents projets et le stack techno en général.
Prendre part aux discussions et à la conception de l’architecture front-end du projet principal sur lequel il est assigné mais également sur les autres projets lorsque nécessaire.

Nos stacks techniques

Au-devant du marché

Toutes les applications développées par FerLab sont à code source ouvert sur GitHub, nous privilégions d’ailleurs l’utilisation de logiciels Open Source. Agile, nous sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire. 

À la recherche des meilleures solutions, nous travaillons avec les plus récentes technologies telles que: Nextflow, Kubernetes, Docker, Python, R, SQL, StarRocks, Elasticsearch, Git, Github, Oauth2, Keycloak, AWS, Openstack, JWT, REST et autres outils d’intégration continue, ainsi que des outils d’IA tels Claude Code. 

Conditions
Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse !

35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire. 
Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines. 
9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) – toujours pratique quand l’école ferme ou que le petit dernier a le nez qui coule. 
13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) – ici, on a 3 raisons de plus de célébrer ! 
On vous offre un fonds de pension bien généreux – l’un des meilleurs sur le marché, rien de moins. 
Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille. 
Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel. 
Possibilité de télétravail. 
Environnement de travail Linux ou Mac à votre choix

Nous recherchons une personne ayant : 

Posséder un baccalauréat en informatique, génie logiciel ou domaine équivalent
Avoir plusieurs années d’expérience professionnelle en développement logiciel web
Expérience avec Spark et Scala (atout majeur)
Expérience avec AWS (atout majeur)
Expérience avec Keycloak ou autre serveur OIDC (un atout)
Expérience avec le framework React shadcn (un atout)
Une connaissance des environnements Linux (Cloud est un atout) 
Être confortable dans un environnement agile et collaboratif
Avoir l’esprit technique et en mode solution
Être curieux et aimer apprendre 
Un bon esprit d’équipe, une aptitude à résoudre des problèmes et une grande autonomie
Un intérêt marqué pour la recherche en santé et les maladies rares 
La maitrise du français tant à l’oral qu’à l’écrit est essentielle pour ce poste.
Cette offre d’emploi s’adresse exclusivement aux personnes résidant actuellement au Québec. Les candidatures provenant de l’extérieur de la province ne seront pas considérées

","developpeur-full-stack-senior","Ferlab | Développeur | Full-stack senior Une équipe du CHU Sainte-Justine Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications logicielles que l’équipe Ferlab du CHU Sainte-Justine développe servent à optimiser l’utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l’amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.   Développeur | Full-stack senior Une carrière complètement différente Notre équipe s’agrandit ! Vous désirez mettre votre expérience en développement et en implantation d’outils au profit de la cause et ainsi contribuer positivement à la société ? C’est dans une atmosphère d’entraide et d’harmonie que nous faisons avancer les mandats qui nous tiennent à cœur. FerLab est à la recherche d’un développeur full-stack doté d’une solide expertise en développement logiciel web. Un leader naturel qui prend les devants, entraîne les autres et qui souhaite contribuer activement à des projets innovants. Votre rôle  Libre dans vos fonctions Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission. Concevoir, corriger et tester des fonctionnalités en React Concevoir, corriger et tester des fonctionnalités Nodejs, Spark et/ou Scala. Améliorer la qualité du code et des applications par l’écriture de tests. Contribuer à bâtir une librairie de composantes spécialisées et partagées entre nos applications. Assister à différentes rencontres de projet lorsque nécessaire. Proposer des solutions d’amélioration et d’avancement technologique pour les différents projets et le stack techno en général. Prendre part aux discussions et à la conception de l’architecture front-end du projet principal sur lequel il est assigné mais également sur les autres projets lorsque nécessaire. Nos stacks techniques Au-devant du marché Toutes les applications développées par FerLab sont à code source ouvert sur GitHub, nous privilégions d’ailleurs l’utilisation de logiciels Open Source. Agile, nous sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire.  À la recherche des meilleures solutions, nous travaillons avec les plus récentes technologies telles que: Nextflow, Kubernetes, Docker, Python, R, SQL, StarRocks, Elasticsearch, Git, Github, Oauth2, Keycloak, AWS, Openstack, JWT, REST et autres outils d’intégration continue, ainsi que des outils d’IA tels Claude Code.  Conditions Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse ! 35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire.  Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines.  9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) – toujours pratique quand l’école ferme ou que le petit dernier a le nez qui coule.  13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) – ici, on a 3 raisons de plus de célébrer !  On vous offre un fonds de pension bien généreux – l’un des meilleurs sur le marché, rien de moins.  Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille.  Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel.  Possibilité de télétravail.  Environnement de travail Linux ou Mac à votre choix  Nous recherchons une personne ayant :  Posséder un baccalauréat en informatique, génie logiciel ou domaine équivalent Avoir plusieurs années d’expérience professionnelle en développement logiciel web Expérience avec Spark et Scala (atout majeur) Expérience avec AWS (atout majeur) Expérience avec Keycloak ou autre serveur OIDC (un atout) Expérience avec le framework React shadcn (un atout) Une connaissance des environnements Linux (Cloud est un atout)  Être confortable dans un environnement agile et collaboratif Avoir l’esprit technique et en mode solution Être curieux et aimer apprendre  Un bon esprit d’équipe, une aptitude à résoudre des problèmes et une grande autonomie Un intérêt marqué pour la recherche en santé et les maladies rares  La maitrise du français tant à l’oral qu’à l’écrit est essentielle pour ce poste. Cette offre d’emploi s’adresse exclusivement aux personnes résidant actuellement au Québec. 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Ferlab | Génie logiciel

Une équipe du CHU Sainte-Justine

Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications et technologies que nous développons servent à optimiser l’utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l’amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.

Développeur | Logiciel en bioinformatique

Une carrière complètement différente

Notre équipe s’agrandit !  Vous désirez mettre votre expérience en développement de logiciels au profit de la cause et ainsi contribuer positivement à la société ? C’est dans une atmosphère d’entraide et d’harmonie que nous faisons avancer les mandats qui nous tiennent à cœur.

Votre rôle 

Libre dans vos fonctions

Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission.

Création, gestion et maintenance des pipelines d’analyse des données génomiques selon les standards Nextflow / nf-core (DSL2, modules, configurations), dans différents types d’environnements (HPC, CLoud, Kubernetes).
Concevoir, corriger et tester diverses fonctionnalités et outils en lien avec les pipelines ainsi que la gestion des données génomiques.
Améliorer la qualité du code et des applications par l’écriture de tests.
Effectuer le benchmarking, la validation et le suivi de performance des pipelines sur des jeux de données référence.
Agir comme personne ressource en bioinformatique et en omique pour le reste de l’équipe.
Participer aux revues de code (code reviews) des autres membres de l’équipe.
Proposer des solutions d’amélioration et d’avancement technologique pour les différents projets et le stack techno en général.
Participer à la documentation des différents processus.

Nos stacks techniques

Au-devant du marché

Chez FerLab toutes les applications que nous créons sont à code source ouvert sur GitHub, nous privilégions d’ailleurs l’utilisation de logiciels Open Source. Agile, nous sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire.

À la recherche des meilleures solutions, nous travaillons avec les plus récentes technologies telles que: Nextflow, Kubernetes, Docker, Python, Spark, R, SQL, Elasticsearch, Git, Github, Oauth2, Keycloak, AWS, Openstack, JWT, REST et autres outils d’intégration continue.

Parce que vous faites une différence
Nous voulons aussi en faire une pour vous
Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse !

Télétravail ou présentiel – vous décidez selon ce qui vous convient le mieux.
35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire.
Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines.
9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) – toujours pratique quand l’école ferme ou que le petit dernier a le nez qui coule.
13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) – ici, on a 3 raisons de plus de célébrer !
On vous offre un fonds de pension bien généreux – l’un des meilleurs sur le marché, rien de moins.
Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille.
Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel.
Et, vous êtes libre de choisir votre environnement de travail - Linux ou Mac!

Pour former une équipe unie

Pas besoin d’être expert en biologie ou en médecine pour faire partie de notre équipe, l’essentiel est de :

Posséder une maitrise ou un doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique ou domaine équivalent.
Connaissance de la bioinformatique et la génomique (obligatoire).
Avoir une excellente connaissance des formats de données utilisés en génomique (FASTQ, BAM, CRAM, VCF, gVCF, et PLINK).
Expérience démontrée avec Nextflow et les conventions nf-core (DSL2).
Expérience pratique avec au moins deux types de données omiques (WGS/WES, RNA-seq, single-cell, long-read, ATAC, etc..).
Maitrise des conteneurs (Docker, Singularity/Apptainer) et d’un ordonnanceur HPC (SLURM).
Expérience en transcriptomique (un atout).
Avoir de l’expérience professionnelle en développement logiciel.
À l’aise avec la culture de revue de code (code reviews).
Capacité à communiquer des concepts bioinformatiques à un public non spécialiste (cliniciens, développeurs, gestionnaires).
Rigueur en communication technique (README, documentation de modules, décisions d’architecture).
Être confortable dans un environnement agile et collaboratif
La maitrise du français tant à l’oral qu’à l’écrit est essentielle pour ce poste.
Cette offre d’emploi s’adresse exclusivement aux personnes résidant actuellement au Québec. Les candidatures provenant de l’extérieur de la province ne seront pas considérées
Avoir l’esprit technique et en mode solution
Être curieux et aimer apprendre 
Être aussi passionné de la cause que nous !

Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique.

","developpeur-logiciel-en-bioinformatique","Ferlab | Génie logiciel Une équipe du CHU Sainte-Justine Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications et technologies que nous développons servent à optimiser l’utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l’amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde. Développeur | Logiciel en bioinformatique Une carrière complètement différente Notre équipe s’agrandit !  Vous désirez mettre votre expérience en développement de logiciels au profit de la cause et ainsi contribuer positivement à la société ? C’est dans une atmosphère d’entraide et d’harmonie que nous faisons avancer les mandats qui nous tiennent à cœur. Votre rôle  Libre dans vos fonctions Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission. Création, gestion et maintenance des pipelines d’analyse des données génomiques selon les standards Nextflow / nf-core (DSL2, modules, configurations), dans différents types d’environnements (HPC, CLoud, Kubernetes). Concevoir, corriger et tester diverses fonctionnalités et outils en lien avec les pipelines ainsi que la gestion des données génomiques. Améliorer la qualité du code et des applications par l’écriture de tests. Effectuer le benchmarking, la validation et le suivi de performance des pipelines sur des jeux de données référence. Agir comme personne ressource en bioinformatique et en omique pour le reste de l’équipe. Participer aux revues de code (code reviews) des autres membres de l’équipe. Proposer des solutions d’amélioration et d’avancement technologique pour les différents projets et le stack techno en général. Participer à la documentation des différents processus. Nos stacks techniques Au-devant du marché Chez FerLab toutes les applications que nous créons sont à code source ouvert sur GitHub, nous privilégions d’ailleurs l’utilisation de logiciels Open Source. Agile, nous sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire. À la recherche des meilleures solutions, nous travaillons avec les plus récentes technologies telles que: Nextflow, Kubernetes, Docker, Python, Spark, R, SQL, Elasticsearch, Git, Github, Oauth2, Keycloak, AWS, Openstack, JWT, REST et autres outils d’intégration continue. Parce que vous faites une différence Nous voulons aussi en faire une pour vous Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse ! Télétravail ou présentiel – vous décidez selon ce qui vous convient le mieux. 35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire. Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines. 9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) – toujours pratique quand l’école ferme ou que le petit dernier a le nez qui coule. 13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) – ici, on a 3 raisons de plus de célébrer ! On vous offre un fonds de pension bien généreux – l’un des meilleurs sur le marché, rien de moins. Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille. Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel. Et, vous êtes libre de choisir votre environnement de travail - Linux ou Mac! Pour former une équipe unie Pas besoin d’être expert en biologie ou en médecine pour faire partie de notre équipe, l’essentiel est de : Posséder une maitrise ou un doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique ou domaine équivalent. Connaissance de la bioinformatique et la génomique (obligatoire). Avoir une excellente connaissance des formats de données utilisés en génomique (FASTQ, BAM, CRAM, VCF, gVCF, et PLINK). Expérience démontrée avec Nextflow et les conventions nf-core (DSL2). Expérience pratique avec au moins deux types de données omiques (WGS/WES, RNA-seq, single-cell, long-read, ATAC, etc..). Maitrise des conteneurs (Docker, Singularity/Apptainer) et d’un ordonnanceur HPC (SLURM). Expérience en transcriptomique (un atout). Avoir de l’expérience professionnelle en développement logiciel. À l’aise avec la culture de revue de code (code reviews). Capacité à communiquer des concepts bioinformatiques à un public non spécialiste (cliniciens, développeurs, gestionnaires). Rigueur en communication technique (README, documentation de modules, décisions d’architecture). Être confortable dans un environnement agile et collaboratif La maitrise du français tant à l’oral qu’à l’écrit est essentielle pour ce poste. Cette offre d’emploi s’adresse exclusivement aux personnes résidant actuellement au Québec. Les candidatures provenant de l’extérieur de la province ne seront pas considérées Avoir l’esprit technique et en mode solution Être curieux et aimer apprendre  Être aussi passionné de la cause que nous ! Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. 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